化学信息学建模
将特征计算嵌入 Python 训练脚本。
平台简介
PyBioMed 是面向化学与生物分子数据分析的 Python 工具包，提供化学结构、蛋白质、DNA 及相互作用样本的特征表征方法。
工具包支持分子数据获取与预处理、描述符和指纹计算以及序列特征生成，可作为统计分析和机器学习建模流程的特征计算组件。
- Category
- Descriptor
- Version
- v1.0.0
核心功能
- 01
数据获取与预处理
通过程序接口准备化学及生物分子数据。
- 02
多类型描述符
生成化学结构、蛋白质和 DNA 特征。
- 03
相互作用特征
组合成对样本的分子表示。
演示视频
演示视频准备中
平台操作演示将在视频制作完成后上线。
应用场景
生物相互作用分析
构建蛋白质、核酸与化合物样本的输入特征。
代表论文
PyBioMed: a python library for various molecular representations of chemicals, proteins and DNAs and their interactions
Dong J, Yao ZJ, Zhang L, et al. · Journal of Cheminformatics · 2018